«Борис Годунов» (1869)
«Женитьба» (Marriage, досочинена и оркестрована М. М. Ипполитовым-Ивановым, 1931)
«Саламбо, или Ливиец» (Salammbô, or The Libyan, 1866) - незавершенная
«Сорочинская Ярмарка» (Sorochintsï Fair, окончена Ц. А. Кюи, 1913)
«Хованщина» (Khovanshchina, 1886) - незавершенная
«Эдип в Афинах» (Oedipus in Athens, 1861) - незавершенная
Кроме того, на его музыку поставлены балеты:
«Видения» (1945, Стокгольм, балетм. Ю. Алго)
«Картинки с выставки»
«Ночь на Лысой горе» (балетм. Игорь Моисеев, 2003)
«Сорочинская ярмарка» (в аранжировке Н.Н. Черепнина; 1943, балетм. Д. Лишин)
